Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Piezo1E2JF22 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Piezo1E2JF22 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms