Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cngb1E1AZ71 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms