Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms