Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms