Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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