Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms