Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms