Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc8B2RUS7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Abcc8B2RUS7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms