Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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