Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol7aB2RT54 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms