Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms