Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms