Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b1B1AZQ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms