Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PtprsB0V2N1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprsB0V2N1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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PtprsB0V2N1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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PtprsB0V2N1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtprsB0V2N1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtprsB0V2N1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprsB0V2N1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprsB0V2N1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprsB0V2N1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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