Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms