Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint5A7XUY5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint5A7XUY5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms