Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp4A4UUI3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms