Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttll11A4Q9F4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttll11A4Q9F4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms