Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ism1A2ATD1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ism1A2ATD1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms