Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms