Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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