Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd7A2AJK6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms