Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tbc1d16A2ABG4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d16A2ABG4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms