Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef6A2A8M8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms