Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1lA2A5N3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1lA2A5N3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms