Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SW31

BC029722, cDNA sequence BC029722, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC029722A0A0N4SW31 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
BC029722A0A0N4SW31 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
BC029722A0A0N4SW31 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms