Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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