Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSK7

Gm28778, Predicted gene 28778 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28778A0A087WSK7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28778A0A087WSK7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms