Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28490A0A087WRT9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms