Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SYCP1Q15431 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
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SYCP1Q15431 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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