Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATMQ13315 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATMQ13315 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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