Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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DDX39BQ13838 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDX39BQ13838 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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