Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcniQ9Z2V9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms