Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms