Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms