Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms