Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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