Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrdQ9Z0E2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrdQ9Z0E2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms