Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx9Q9WUH2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms