Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms