Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms