Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim3Q9R1R2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms