Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr54Q9R0D8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Wdr54Q9R0D8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms