Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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