Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npas3Q9QZQ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms