Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms