Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms