Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Opn4Q9QXZ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn4Q9QXZ9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms