Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip4Q9QXN3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms