Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms